Quy hoạch vùng Đông Nam Bộ xác định Cảng trung chuyển quốc tế Cần Giờ là một trong những dự án quan trọng của vùng, sẽ thực hiện cả trước và sau năm 2030.
Có tổng cộng 44 dự án quan trọng được xác định trong quy hoạch này, trong đó có 10 dự án nằm trong quy hoạch tổng thể quốc gia. Cảng trung chuyển quốc tế Cần Giờ là một trong 34 dự án khác sẽ được thực hiện theo phân kỳ.
Quy hoạch xác định sẽ tập trung phát triển khu bến cảng cửa ngõ quốc tế Cái Mép Thị Vải và xây dựng khu bến cảng Cần Giờ trở thành cảng trung chuyển quốc tế, hình thành cụm cảng lớn phục vụ phát triển kinh tế, xã hội của vùng và khu vực.
Đến năm 2050, quy hoạch sẽ đầu tư xây dựng các khu bến cảng mới tại Cần Giờ, di dời các bến cảng trên sông Sài Gòn và nghiên cứu di dời các khu bến khác phù hợp với phát triển không gian đô thị TP.HCM.
Quy hoạch cũng xác định sẽ hoàn thiện các cơ chế, chính sách, quy định liên quan về quản lý hàng hải để tạo điều kiện thuận lợi cho cảng Cái Mép - Thị Vải và cảng Cần Giờ hoạt động như cảng trung chuyển quốc tế, có sức cạnh tranh với các cảng trong khu vực.
Thủ tướng lưu ý cần nghiên cứu lựa chọn nhà đầu tư chiến lược, có năng lực, kinh nghiệm để đầu tư tổng thể vào Cảng trung chuyển quốc tế Cần Giờ nhằm phát huy tối đa năng lực khai thác của hệ thống cảng biển và cạnh tranh lành mạnh với các cảng biển khác trong khu vực Đông Nam Á.